Многие пациентки отмечают болевой синдром. Чаще всего это боли внизу живота, в проекции кисты, которые появляются накануне и/или в начале менструации. Подобная боль связана с тем, что при эндометриозе отторгающиеся при менструации ткани расположены не только в полости матки, но и в эндометриоидных очагах (в кисте). Соответственно, суммарная площадь отторгающихся клеток увеличена. А это неминуемо ведет к нарастанию болезненных ощущений при менструации.